Η Αντιγόνη Ζαφειράκου είναι Αναπληρώτρια Καθηγήτρια του τμήματος Πολιτικών Μηχανικών της Πολυτεχνικής Σχολής του Αριστοτέλειου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης (ΦΕΚ 1277/03-06-2021 τ.Γ’). Κάτοχος Διδακτορικού διπλώματος (PhD Civil & Environmental Engineering) του Πανεπιστημίου Tufts, ΗΠΑ (2000), Μεταπτυχιακού διπλώματος (MSc Civil & Environmental Engineering) του Πανεπιστημίου του Connecticut, ΗΠΑ (1994), και Διπλώματος Πολιτικού Μηχανικού από το Α.Π.Θ. (1991).
Τα διδακτικά και ερευνητικά της ενδιαφέροντα είναι στην περιβαλλοντική μηχανική, την βιώσιμη διαχείριση του νερού και των υγρών αποβλήτων, και την παρακολούθηση και διαχείριση της θαλάσσιας ρύπανσης. Είναι συγγραφέας του κεφαλαίου Sustainable urban water management, στο βιβλίο City Networks – Collaboration and Planning for Health and Sustainability, Springer (2017), του κεφαλαίου Oil spill dispersion forecasting models, στο βιβλίο Monitoring of marine pollution, InTech Open Access (2018), και συ-συγγραφέας (Vogel et al.) του κεφαλαίου Hydrologic Record Events, στο βιβλίο Statistical Analysis of Hydrologic Variables. Methods and Applications, ASCE (2019), και του Water Management of cross-border waterbodies. Possibilities for joint cooperation in coping with the challenges (2020) σε συνεργασία με το Τμήμα Μηχανολόγων Μηχανικών του Πανεπιστήμιου Κύριλλου και Μεθόδιου των Σκοπίων, Β.Μ.
Έχει δημοσιεύσει άνω από 50 επιστημονικά άρθρα σε έγκριτα περιοδικά και πρακτικά συνεδρίων, με περισσότερες από 350 ετεροαναφορές (h-index 9), κριτής σε ερευνητικά έργα (US Dept of Energy ΗΠΑ, ΙΚΥ-ΕΥΔΑΠ), Guest Editor σε Ειδικά Τεύχη (Special Issues: FEB, SPR, MDPI), κριτής περιοδικών (Desalination and Water Treatment, Environmental Processes, Springer, ESPR, Fresenius Environmental Bulletin, Journal of Marine Science and Environment – JMSE, Waste Management Journal, Elsevier) και συνεδρίων (International Conference on Civil Engineering and Urban Planning – CEUP, Efficient Water Systems – EwaS, International Conference on Water Resource and Environment – WRE), μέλος οργανωτικών και επιστημονικών επιτροπών σε διεθνή συνέδρια (Protection and Restoration of the Environment, GreenChem, CEMEPE/SECOTOX, SWAT, OpenEARTH), μέλος της επιτροπής αναγόρευσης του Dr. George Tchobanoglous σε Επίτιμο Διδάκτορα του Τμήματος Πολιτικών Μηχανικών του Α.Π.Θ. Μέλος του ΤΕΕ (Τεχνικό Επιμελητήριο Ελλάδας), ΕΥΕ (Ελληνική Υδροτεχνική Ένωση), INWEB και πρόσφατα μόνο ακαδημαϊκό μέλος από την Ελλάδα του Water Footprint Network (https://www.waterfootprint.org/). Συντονίστρια του Συμφώνου Συνεργασίας μεταξύ της Πολυτεχνικής Σχολής του Α.Π.Θ. και του Ελληνικού Δικτύου Δήμων με Ποτάμια, επίσης του Συμφώνου Συνεργασίας μεταξύ του Τμήματος Πολιτικών Μηχανικών του Α.Π.Θ. με το Δίκτυο των Πόλεων με Λίμνες. Επίσης ενεργό μέλος σε επιτροπές φοιτητικών διαγωνισμών GreenTech Challenge (Ε.Μ.Π.), BEST, IACES, COMVOS.