Ο κ. Παπαδάκης είναι Διευθύνων Σύμβουλος του Φορέα Πιστοποίησης IQCert (Διεθνής Φορέας Πιστοποίησης Α.Ε.) και Επιθεωρητής Συστημάτων Διαχείρισης από το 2003. Η διδακτορική του διατριβή πραγματοποιήθηκε στην περιοχή της Μετρολογίας στην Αναλυτική Χημεία.

Διδάσκει, ως Συνεργαζόμενο Εκπαιδευτικό Προσωπικό, στο Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών «Διαχείριση και Τεχνολογία Ποιότητας (ΔΙΠ)», ενώ έχει διατελέσει επισκέπτης επίκουρος καθηγητής στο τμήμα Χημείας του Πανεπιστημίου Κύπρου την περίοδο 2001-2002.

Είναι Αξιολογητής και Εμπειρογνώμονας του ΕΣΥΔ (από το 2003) ενώ έχει διατελέσει μέλος του Εθνικού Συμβουλίου Διαπίστευσης ως Εκπρόσωπος Καταναλωτών κατά την περίοδο 2013-2017,  μέλος της ΕΤΕ 1 του ΕΣΥΔ (2002-2005), μέλος της ΓΤΕΡ του ΕΣΥΔ (2005-2012) και Πρόεδρος της ΕΤΕΡ 2 του ΕΣΥΔ (2005-2012).

Από το 2009 διατελεί συνεργάτης στο εκπαιδευτικό δίκτυο TrainMiC (Training on Metrology in Chemistry) υπό την αιγίδα της Ευρωπαϊκής Επιτροπής.

Τέλος, ο Δρ. Παπαδάκης εργάστηκε στο Ινστιτούτο Υλικών και Μετρήσεων Αναφοράς (IRMM – Institute for Reference Materials and Measurements) του Κοινού Κέντρου Ερευνών (JRC – Joint Research Center).